Det finnes flere metoder for påvisning av antistoff, men i dag anvendes i all hovedsak enzym-immunoassay (EIA). Metoden kan bygges opp på ulike måter.
Til veggene i brønnene er det bundet proteinantigen fra en mikroorganisme. Ved tilsetting av pasientserum til brønnen vil antistoffer mot dette antigenet binde seg. Etter vask for å fjerne ubundet antistoff tilsettes anti-antistoff mot pasientens IgG eller IgM (eller IgA). Dette anti-antistoffet har kovalent bundet på seg et enzym (eks pepperrotperoksydase). Etter ny vask for å fjerne ubundet anti-antistoff tilsettes et substrat for enzymet.
Dersom enzym (dvs komplekset antigen+antistoff+anti-antistoff) er til stede i brønnen vil man få en fargeutvikling. Dersom enzym ikke er til stede i brønnen (dvs pasientens serum ikke inneholdt antistoffer mot det valgte antigenet, og man ikke får et kompleks), skjer ingen fargeutvikling. Fargestyrken vil være proporsjonal med mengden bundet antistoff i prøven.