Ukjent med en sterk genetisk forbindelse idet 90-95 % av de rammede har vevstype HLA-B27
Risiko for utvikling hos HLA-B27 positive er 1-2 % mot 0,05 % i resten av befolkningen. HLA-B27 er imidlertidig verken en nødvendig eller tilstrekkelig forutsetning for å utvikle Bekhterevs sykdom.
Sykdommen beror trolig på et samspill mellom belastningsutløste vevslesjoner, lokale reaksjoner på mikrobielle antigener og genetiske disposisjoner i form av HLA-B27 vevsegenskaper.